La observación de microorganismos unicelulares así como de células, tejidos y órganos animales y vegetales, requiere un microscopio que tenga una dotación básica de calidad a la vez que, a excepción de la observación vital, es imprescindible que el material sea preparado de forma adecuada. El tipo de preparación del material a estudiar viene condicionado por el tipo de microscopio que se vaya a utilizar. Mientras en determinados casos las células y los cortes histológicos deben ser sometidos a la acción de fluorocromos, para su observación con el microscopio de fluorescencia o con el microscopio confocal, en otros casos se recurre a la utilización de sales de metales pesados que actúan sobre cortes ultrafinos para ser estudiados con el microscopio electrónico de transmisión. En cualquier caso, para la identificación de los detalles estructurales se requiere una base teórica de conocimientos y ejercitarse en la observación.
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